来源:《分析化学》2021年第05期 作者:周岳;黄敏;李想;关锋;
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3种轨道阱质谱仪数据非依赖性扫描的定量分析蛋白质组学性能评测

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基于数据非依赖性扫描(Data-independent acquisition, DIA)的定量分析蛋白质组学已广泛应用于生命科学和临床蛋白质组学研究。本研究选择3种蛋白质组学研究常见的轨道阱(Orbitrap)质谱仪(Q Exactive Plus、 Q Exactive HF-X和Orbitrap Fusion Lumos)进行DIA定量分析性能的比较。针对每台质谱仪建立了相应的DIA定量分析方法,采用商业化的Hela酶切肽段、去除高丰度蛋白质的血浆样品和已知比例的血浆和酵母混合样品评价每台质谱仪的蛋白质组覆盖深度、定量分析的重现性、准确性和精密度。在100 ng Hela酶切肽段样品中,采用60 min梯度洗脱,每台质谱仪定量分析34000~37000条多肽和4400个蛋白质,蛋白质强度变异系数的中位数低于5%,可同时被3台质谱仪定量分析的多肽和蛋白数量比例分别为81%和96%。在去除高丰度蛋白质的血浆样品中,采用60 min梯度洗脱,每台质谱仪定量分析4400~5100条多肽和550~620个蛋白质,其蛋白质强度变异系数的中位数低于5%,可同时被3......(本文共计15页)       [继续阅读本文]

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分析化学杂志2021年第05期
分析化学
主办:中国化学会;中国科学院长春应用化学研究所
出版:分析化学杂志编辑部
出版周期:月刊
出版地:吉林省长春市

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