来源:《海洋科学进展》2019年第02期 作者:王闻;范士亮;李晋;高伟;金玉休;郑明刚;郑立;
选择字号

盐地碱蓬AGO蛋白基因家族的分离及表达分析

分享到: 分享到QQ空间

AGO蛋白(Argonature protein)作为RNA诱导沉默复合物的核心元件,在植物的非生物胁迫过程中发挥着重要作用。以前期获得的盐地碱蓬转录组数据为基础,开展了针对盐地碱蓬(Suaeda salsa)AGO蛋白的生物信息学及盐胁迫下的表达规律研究。采用RACE技术克隆2个AGO基因家族成员(SsAGO1、SsAGO16)的cDNA全长序列,并对其蛋白结构、进化关系、表达模式等进行分析。结果表明:盐地碱蓬2类AGO蛋白家族成员基因长度分别为3 212 bp和3 766 bp,编码的蛋白均是一个无跨膜结构域、无信号肽的亲水性蛋白,α-螺旋散布于每个蛋白质的整体结构中;SsAGO1和SsAGO16都含有一个未知的结构域DUF1785,除此之外,SsAGO1还含有PAZ和PIWI两个特征结构域,而SsAGO16仅含有PIWI结构域,SsAGO1和SsAGO16亲缘关系较远,且具有不同的时空表达模式。首次从盐地碱蓬鉴定了AGO蛋白基因并进行了盐胁迫下的表达规律分析,为研究AGO蛋白家族在盐生植物耐盐生理过程中的作用奠定了基础。(本文共计9页)       [继续阅读本文]

下载本文订阅本刊

相关文章推荐

海洋科学进展杂志2019年第02期
海洋科学进展
主办:中国海洋学会;国家海洋局第一海洋研究所
出版:海洋科学进展杂志编辑部
出版周期:季刊
出版地:山东省青岛市

本期目录